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QuantStudio 3 在設計上能夠進行長時間的實驗,例如在運行標準96孔板時,一個典型的qPCR程序本身就需要1.5到2.5小時。儀器本身具備連續運行24小時甚至更久的硬件能力。
然而,能否順利實現24小時連續運行,關鍵在于實驗設計、樣品和試劑穩定性以及無人值守的風險管理。以下是詳細的解釋和注意事項:
一、支持24小時運行的理由
1、硬件設計:儀器的加熱塊、光學檢測系統和控制軟件都支持長時間運行。您可以輕松設置一個循環數多、退火/延伸時間長的程序,總時長超過24小時。
2、軟件支持:QuantStudio Design and Analysis 軟件允許您設置并運行長達數天的實驗程序。
二、實現24小時連續運行的關鍵前提與注意事項
1、反應體系蒸發問題(最關鍵!)
必須使用光學蓋膜或封板膜:不能直接使用普通的板蓋。需要使用專門的熱封膜(如 MicroAmp™ Optical Sealing Film)或光學透明的粘性封板膜,并用相應的封板器將其緊密密封,防止在長時間高溫循環中液體蒸發,導致反應失敗和儀器污染。
驗證密封性:確保封膜沒有褶皺或未封緊的區域。
2、試劑和酶的穩定性
使用長效酶:普通的Taq酶在長時間高溫循環下可能會失活。如果您計劃運行一個非常長的程序(例如超過3-4小時),強烈建議使用為“長片段PCR"或“長時間擴增"設計的特殊酶 mix,這些酶具有更好的熱穩定性。
Mix的穩定性:確保您使用的預混液(Master Mix)制造商沒有標明不適用于超長運行時間。
3、實驗設計的合理性
循環數:通常40個循環已經足夠檢測絕大多數模板。設置過高的循環數(如60-80循環)不僅不必要,還可能增加背景噪音和蒸發風險。請根據您的模板濃度合理設置循環數。
程序步驟時間:延長退火/延伸時間會增加總運行時間。請確認您的擴增片段長度是否需要這么長的延伸時間。
4、無人值守的風險
電力保障:確保實驗室供電穩定,有UPS(不間斷電源)支持,防止意外斷電導致實驗中斷和數據丟失。
儀器狀態:在離開前,確認儀器運行正常,沒有報錯信息。
環境溫度:確保儀器周圍通風良好,環境溫度不會過高。
三、總結與建議
1、可以做到:QuantStudio 3 在技術上能夠單次連續運行24小時。
2、不推薦常規化:除非有特殊實驗需求(如使用特殊的長片段酶),否則不建議常規設計單次長達24小時的qPCR程序。更好的做法是優化實驗方案,縮短運行時間,或采用分批上樣的間歇式運行。
3、如果必須進行:
嚴格密封:使用高質量的光學密封膜和封板器。
選擇穩定試劑:確認并使用熱穩定性更高的酶。
進行預實驗:先用少量樣本進行一次長時間運行的預實驗,驗證擴增效率和結果是否可接受。
做好風險管理:確保電力穩定,并告知實驗室相關人員。
4、總而言之,將QuantStudio 3用于24小時連續運行在技術上是可行的,但成功與否高度依賴于您對蒸發控制和試劑穩定性的管理。 在嘗試之前,請務必仔細評估這些風險。