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賽默飛StepOne實時熒光定量PCR儀的操作使用方法的詳細指南。內(nèi)容涵蓋了從實驗準備到數(shù)據(jù)分析的完整流程,并強調(diào)了關(guān)鍵注意事項。
一、賽默飛StepOne實時熒光定量PCR實驗準備
1、儀器與試劑準備
儀器:確保StepOne PCR儀電源穩(wěn)定,電腦已連接并安裝了StepOne Software。
耗材:選擇兼容的PCR反應(yīng)板或八聯(lián)管(如Applied Biosystems™ MicroAmp™系列)和光學蓋膜。
試劑:準備好您的qPCR預(yù)混液、引物/探針、模板DNA/cDNA和無核酸酶水。
2、反應(yīng)體系配制(在試劑準備區(qū)進行)
總體積:通常為20μL或10μL。
建議:配制一個主混合液,然后分裝到各反應(yīng)孔,最后加入模板,以減少加樣誤差和污染。
對照設(shè)置:
無模板對照:用水代替模板,用于檢測試劑污染。
陽性對照:使用已知濃度的標準品,用于驗證實驗有效性。
3、上樣與封膜
將配制好的反應(yīng)體系小心加入到反應(yīng)板或八聯(lián)管中,避免產(chǎn)生氣泡。
使用光學透明蓋膜密封反應(yīng)板。確保蓋膜緊密貼合,無褶皺,防止蒸發(fā)和交叉污染。
二、賽默飛StepOne實時熒光定量PCR上機運行
1、啟動軟件與放置樣品
打開電腦,啟動 StepOne Software。
打開StepOne PCR儀艙門,將密封好的反應(yīng)板放入儀器樣品槽中,確保板子放置方向正確(A1孔在左上角)。
關(guān)閉艙門。
2、創(chuàng)建新實驗
在軟件主界面,點擊 "New Experiment"(新建實驗)。
3、設(shè)置實驗類型
在 "Setup" 選項卡下,選擇實驗類型:
Quantitation (Standard Curve):定量,需要運行標準品來制作標準曲線。
Comparative Ct (ΔΔCt):相對定量,常用,用于分析基因的表達差異。
Melt Curve:熔解曲線,通常在SYBR Green實驗后運行,用于檢查擴增產(chǎn)物的特異性。
Allelic Discrimination:基因分型。
4、編輯樣品孔布局
點擊 "Plate" 選項卡。
在虛擬的反應(yīng)板界面上,用鼠標選擇孔位,然后右鍵或使用左側(cè)工具欄定義其屬性:
樣品類型:未知、陽性對照、陰性對照、標準品。
樣品名稱:如"Sample 1","Control"等。
目標基因:為每個孔指定檢測的基因(如GAPDH, Target Gene)。軟件允許在同一塊板上進行多基因檢測。
重復(fù):設(shè)置技術(shù)重復(fù)。
5、運行實驗
檢查所有設(shè)置無誤后,點擊軟件右上角的 "Start Run"(開始運行)按鈕。
輸入實驗名稱和保存路徑。
儀器將開始運行,您可以在軟件界面上實時查看擴增曲線和溫度狀態(tài)。
三、日常維護
1、清潔:定期用70%乙醇和無塵紙清潔樣品槽表面。
2、校準:根據(jù)儀器提示或定期進行光學校準。
3、記錄:記錄每次使用情況和任何異常。